Fue fundada por los MFSC en 1960 y empezó a funcionar en 1965 como Noviciado. Las obras del edificio actual comenzaron en 1966. Los intercambios entre ambos Institutos con vistas a la unificación aconsejaron el traslado de los novicios y escolásticos a Moncada en 1970, destinándose la casa de Palencia a la formación de los cursos superiores de bachillerato de ambos Institutos. En 1985 esta etapa de la formación pasó a Saldaña, quedando Palencia como Centro de Animación Misionera (CAM), al que se añadió en 1987 el Seminario en Familia o Camino Juvenil Comboniano (CAJUCO). Con el cierre de Saldaña en septiembre de 1992, la comunidad pasó a Palencia donde se continuó con el Seminario Menor, la Animación Misionera y la Pastoral Vocacional. La experiencia del Seminario en Familia terminó en 1994 dada su poca viabilidad y resultados. El Seminario Menor se cerró al año siguiente. La escasez de candidatos y el cambio de sistema educativo en España forzaron esos cambios.
En marzo de 2011 se decidió proceder a la venta de la casa, en el contexto de la revisión de estructuras propuesto por el Capítulo General y el Plan Sexenal de la Provincia.
Ante la imposibilidad de encontrar un comprador para la casa, la Provincia de España decidió, en 2022, remodelar la casa y acondicionarla para misioneros combonianos mayores.
Desde el 9 de septiembre de 202…, fiesta de San Pedro Claver, patrono de la comunidad comboniana de Palencia, comenzó una nueva etapa como: centro de acogida para hermanos mayores y centro para la Animación Misionera en Castilla y León y las regiones de alrededor, También está abierta a la cooperación, según las posibilidades, en la pastoral de la diócesis de Palencia.
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